現在のラボ:セントラルラボ

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項目コード:00Y91 6(旧 0Y91 6)
検査項目
JLAC10
次世代シーケンサーを用いて、膨大な数のDNA断片の塩基配列の決定を、同時並行的に行う方法。
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がん患者由来のホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)腫瘍組織検体から抽出したゲノムDNAを用いてAKT1遺伝子変異、PIK3CA遺伝子変異、PTEN遺伝子変異を検出し、乳癌に対する薬剤の適応を判断することを目的としております。
検査に必要な腫瘍細胞の割合は40%以上が推奨(最小20%以上)です。
未染標本スライド提出に際しての留意事項は検体作製ガイドおよび下記をご参照ください。
他項目との重複依頼は避けてください。本検査方法ではコンタミネーションの影響がより大きくなりますので、検体採取にあたっては取り扱いに充分ご注意ください。
凍結保存は避けてください。
●未染標本スライドの提出に際して
・採取した組織は速やかに10%中性緩衝ホルマリン溶液に浸漬し、固定を行ってください(推奨固定時間は6~48 時間程度)。ご提出の際には、ホルマリン固定パラフィン包埋組織ブロックより厚さ5μm×10枚または厚さ10μm×5枚にて連続切片を作製ください。
・変異を検出するには少なくとも20%の腫瘍細胞含有率が必要です。ただし、PTEN遺伝子のCNV Homozygous deletion検出のためには、腫瘍細胞含有率40%以上を推奨いたします。
・未染標本スライドは、病理組織学的な評価がなされ、検査に必要な腫瘍細胞割合(標本中の全細胞に占める腫瘍細胞の%)以上存在することを確認してください。腫瘍細胞含有率が20%未満の検体につきましては、マクロダイセクション実施後の推定腫瘍細胞含有率が20%以上になるように、ご提出いただくすべてのスライドグラスに裏面から油性ペン等(ダイヤモンドペンの使用はお避けください)でマーキングしてください。マーキングがされないまま提出されますと、マクロダイセクションができず、偽陰性など判定結果に影響を及ぼす可能性がありますので、あらかじめご了承願います。また、未染標本スライドはオブジェクトケース(Z10)に入れ室温保存にてご提出ください。
※以下のような未染スライド検体でのマクロダイセクションはご依頼いただけません。
・未染スライド裏面への腫瘍部位のマーキングがない検体
・HE染色スライドマーキング見本*によるマクロダイセクション指示
*HE染色スライド見本を提出された場合、原則、ご返却はできかねますのでご注意ください。
・腫瘍細胞含有率が20%を下回り、かつマクロダイセクションが実施できない検体
例1:マーキング範囲がおおよそ4mm×4mmを下回る場合
例2:マーキング範囲の合計面積は4mm×4mmを超えるが、個々が微小な斑状に存在し剥離作業が困難な検体 など
・未染標本スライドは、組織のホルマリン固定により核酸が断片化されているため、固定液の種類や組成、固定時間、固定後の検体の保存状態によっては解析不可能となることがあります。可能な限り3年以内に採取したサンプルをご提出ください。特に生検材料は検体が微量であることが多く、パラフィン切片上の組織片自体が僅少である場合や、腫瘍細胞が含まれていない可能性がありますので、あらかじめご注意願います。
・ 切片の大きさは4mm×4mm以上を目安にご用意ください。
・生検材料など腫瘍組織が小さい場合は、充分な腫瘍細胞量の確保のため、1枚のスライドグラスに複数の連続した組織片をのせた状態でご提出ください。
・1つの腫瘍組織検体に異なる部位由来の検体(原発巣と転移巣など)が混在しないようにご注意ください(可能な限り同一ブロックからの薄切を推奨いたします)。
D004-2 01 注2ロ
悪性腫瘍組織検査
遺伝子関連・染色体検査判断料100点※2
![[オブジェクトケース] プレパラート (スライドグラス)](../../common/yoki-images/z10.jpg)
[オブジェクトケース]
プレパラート (スライドグラス)
貯蔵方法:室温
本検査はコンパニオン診断システムとして、AKT1遺伝子変異、PIK3CA遺伝子変異、PTEN遺伝子変異の検出が可能であり、乳癌におけるカピバセルチブ(商品名:トルカプ®錠)の適応判定の補助が可能です。
乳癌
測定法文献名
Li Q, et al:BMC Genomics 20:215, 2019.
臨床意義文献名
Ferlay J. et al:Int J Cancer 149(4):778~789, 2021.